A partir de ese momento, la prosperidad andaluza disminuyó progresivamente, a excepción de los puertos de Sevilla y Cádiz que, al comerciar con el Nuevo Mundo, continuaron prosperando. En 1713, Gibraltar fue cedida a Gran Bretaña y en 1833 la región se dividió en las ocho provincias actuales. Andalucía se convirtió en un bastión del movimiento anarquista durante la República española. Sin embargo, cayó contra los rebeldes en la guerra civil española, sufriendo numerosos hostigamientos, entre ellos, los asesinatos simbólicos y terribles de Federico García Lorca en Granada.

Mucho antes, durante el Siglo XVIII, Andalucía tuvo un papel clave en la historia de España durante la etapa de las invasiones napoleónicas. En Bailén se libró una de las batallas más decisivas de la guerra y en 1812 se redactó la primera Constitución Española en las Cortes de Cádiz.

En años posteriores, comenzaron a darse los primeros intentos de modernización de la industria y la producción. Sin embargo, estos procesos no tuvieron tanta repercusión en Andalucía debido al mal reparto de las tierras y a la negación de las clases más favorecidas a dejar de lado sus privilegios. Es durante esta época cuando comienzan a surgir los primeros vestigios de ideas federalistas, republicanas y radicales. También es en esta época cuando comienzan a forjarse los típicos estereotipos andaluces.